Para cadastro de uma novo cidade
Avançado > Sistema > Cidades;
Clique no +

Informe País, Estado, Cidade e o Código do IBGE* da cidade que você precisa cadastrar;
Confirme;

Para incluir a informação do Código do IBGE* em uma cidade já cadastrada acesse
Avançado > Sistema > Cidades;
Pesquise pela cidade que você precisa informar o código;
Clique sobre o nome para abrir o cadastro;

Clique em "Editar";
Informe o Código do IBGE* no campo específico;
Confirme;

* Caso você não saiba onde conseguir o código do IBGE da cidade que você precisa, acesse o site https://cidades.ibge.gov.br/ e pesquise pela sua cidade.